什么是肿瘤分子检测
肿瘤的发生与细胞内基因的改变有关。分子检测就是在肿瘤组织或血液中寻找这些改变,例如某个基因的突变、两个基因断裂后的融合、基因拷贝数增多,或者某段 DNA 的甲基化状态。
这些信息的用途主要有三类:判断是否有对应的靶向药物;评估免疫治疗的相关指标;以及帮助确定部分肿瘤的类型和预后,例如脑胶质瘤、淋巴瘤和部分肉瘤的诊断分类已经离不开分子检测。
本页所说的分子检测主要针对肿瘤本身的变化(体细胞变异),与判断遗传风险的胚系基因检测不同,下文会说明区别。
不同检测方法分别回答什么问题
| 方法 | 主要回答的问题 | 常见例子 |
|---|---|---|
| PCR 类检测 | 已知位点是否有突变,速度较快 | 肺癌 EGFR 突变、结直肠癌 KRAS / NRAS / BRAF |
| FISH(荧光原位杂交) | 某个基因是否扩增或断裂重排 | HER2 扩增、ALK / ROS1 重排、淋巴瘤 MYC 重排 |
| NGS(二代测序) | 一次检测多个基因的突变、融合、扩增等 | 肺癌多基因检测、TMB、罕见融合 |
| MSI 检测 | 错配修复功能是否缺陷 | 结直肠癌、子宫内膜癌等,与免疫治疗有关 |
| 甲基化检测 | 特定基因启动子是否甲基化 | 胶质母细胞瘤 MGMT,与替莫唑胺疗效相关 |
方法之间没有绝对的优劣:需要检测的基因很少、希望尽快出结果时,PCR 或 FISH 可能更合适;需要同时排查多个基因,或组织有限、不宜逐个检测时,NGS 通常更节省组织。
什么情况下医生可能建议分子检测
| 癌种 | 常见检测内容 |
|---|---|
| 非小细胞肺癌 | EGFR、ALK、ROS1、KRAS、BRAF、MET、RET、HER2、NTRK 等 |
| 结直肠癌 | KRAS / NRAS、BRAF、MSI 或 MMR、HER2 |
| 乳腺癌 | 晚期时可能检测 PIK3CA、ESR1、BRCA1/2 等 |
| 卵巢癌 | BRCA1/2、同源重组修复缺陷(HRD) |
| 脑胶质瘤 | IDH、1p/19q 共缺失、MGMT 甲基化等 |
具体检测项目会随指南和可用药物更新而变化,以主治医生建议为准。
需要什么样本:组织还是血液
肿瘤组织通常是首选样本,一般使用活检或手术后的蜡块或白片。检测要求组织中有足够比例的肿瘤细胞,病理医生会先评估并圈出肿瘤区域。穿刺组织过少、坏死过多,或骨组织经强酸脱钙,都可能导致检测失败。
当组织难以获取或不足时,可以抽血检测血液中的循环肿瘤 DNA(ctDNA),即液体活检。血液检测创伤小,但如果肿瘤释放到血中的 DNA 较少,可能出现假阴性,因此血液检测阴性时,医生常会建议在条件允许时补做组织检测。
检测流程与多久出结果
根据癌种、分期、既往治疗和已有结果,决定检测哪些基因、用哪种方法。
病理医生确认组织中肿瘤细胞含量是否足够,选出合适的蜡块或切片。
从样本中提取 DNA 或 RNA,按所选方法完成检测;NGS 还需要测序和数据分析。
分子病理医生或实验室专业人员按证据等级判断变异的意义,写出报告。
临床医生结合病情判断结果对治疗的意义,必要时在多学科会诊中讨论。
多久出结果
单基因的 PCR 或 FISH 检测通常较快;多基因 NGS 检测流程更长,一般需要更多工作日。样本需要转送、质控不合格需要补样或重新检测时,时间还会延长。病情急需治疗时,医生可能先选择较快的检测方法。
如何理解分子检测报告
多基因检测报告常参考 AMP/ASCO/CAP 等标准,把体细胞变异按临床意义分为四级。不同机构的写法略有不同,常见思路如下:
| 常见分级 | 含义 |
|---|---|
| 一级:有明确临床意义 | 本癌种有获批药物或指南推荐的治疗与之对应 |
| 二级:有潜在临床意义 | 其他癌种有获批药物,或有临床试验、早期研究证据 |
| 三级:意义未明变异(VUS) | 目前证据不足以判断是否与肿瘤有关,一般不据此用药 |
| 四级:良性或可能良性 | 通常不影响治疗 |
报告中还可能出现变异丰度(VAF)等数值,其意义与肿瘤细胞含量有关,应由医生结合病情解读。
与胚系基因检测、免疫组化的区别
| 肿瘤分子检测 | 胚系基因检测 | |
|---|---|---|
| 检测对象 | 肿瘤组织或血液中的肿瘤 DNA | 血液或唾液中的正常细胞 DNA |
| 回答的问题 | 肿瘤有哪些变化、可能适合哪些药物 | 是否携带遗传性致病变异 |
| 对家人的意义 | 一般不直接涉及 | 可能提示家人需要评估或筛查 |
| 常见例子 | EGFR 突变、ALK 融合、MSI | BRCA1/2、林奇综合征相关基因 |
部分肿瘤检测结果会提示可能存在胚系变异,例如肿瘤中发现 BRCA1/2 变异,这时医生可能建议进一步做胚系基因检测并接受遗传咨询。免疫组化则检测组织中的蛋白表达,与分子检测互为补充,不能完全替代。
是否需要重新取样
以下情况下,医生可能建议重新活检或补充血液检测:
重新活检有一定风险。组织难以获取时,血液检测可以作为补充,但不能完全替代组织检测。
在中国进行分子检测与寄送资料
中国大型肿瘤中心普遍开展 PCR、FISH、NGS 等分子检测,部分医院与第三方检测机构合作。不同检测的范围、方法和收费差异较大,是否需要重新检测、检测哪些基因,以医院评估为准。部分用于指导用药的检测试剂已获国家药品监督管理局批准,开展基因扩增类检测的临床实验室也需通过相应的技术审核,可向医院了解所用方法。
中国对人类遗传资源(包括含有人体基因信息的样本和数据)的采集、保存、出境及用于科研等有专门的管理规定,在中国采集的样本或检测数据如需带出境或用于研究,可能受到限制。如计划把在中国检测后剩余的样本或数据带回原居地,宜事先向医院确认。
先通过 WhatsApp 简单说明诊断和已做过的检测,医学顾问会告诉您需要准备哪些资料进行评估。
常见问题
参考文献
- National Comprehensive Cancer Network (NCCN). NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.
- Association for Molecular Pathology (AMP) / ASCO / CAP. Standards and guidelines for the interpretation and reporting of sequence variants in cancer.
- 中国临床肿瘤学会(CSCO)诊疗指南.
- 中国抗癌协会、中华医学会病理学分会等. 肿瘤分子病理检测相关专家共识.