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治疗技术 · Molecular Testing

肿瘤分子检测:不同方法分别回答什么问题

分子检测是分析肿瘤细胞中 DNA 或 RNA 变化的一类检测,包括 PCR、FISH、NGS、MSI 检测和甲基化检测等。它越来越多地用于选择靶向治疗和免疫治疗,也帮助明确部分肿瘤的诊断。本页说明不同方法的用途、什么时候需要、用什么样本,以及如何理解检测报告。

已广泛应用精准治疗的基础
更新于 阅读约 11 分钟

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要点速览
检测类型检测肿瘤 DNA 或 RNA 变化的一类方法
常见用途寻找可用药的基因变异、辅助诊断与分型、评估 MSI 等
样本类型肿瘤组织为主,部分情况可用血液
出结果单基因检测较快;多基因检测通常需要更长时间

检测方法与范围需根据癌种、分期和已有结果选择,以医生建议为准。

什么是肿瘤分子检测

肿瘤的发生与细胞内基因的改变有关。分子检测就是在肿瘤组织或血液中寻找这些改变,例如某个基因的突变、两个基因断裂后的融合、基因拷贝数增多,或者某段 DNA 的甲基化状态。

这些信息的用途主要有三类:判断是否有对应的靶向药物;评估免疫治疗的相关指标;以及帮助确定部分肿瘤的类型和预后,例如脑胶质瘤、淋巴瘤和部分肉瘤的诊断分类已经离不开分子检测。

本页所说的分子检测主要针对肿瘤本身的变化(体细胞变异),与判断遗传风险的胚系基因检测不同,下文会说明区别。

不同检测方法分别回答什么问题

方法主要回答的问题常见例子
PCR 类检测已知位点是否有突变,速度较快肺癌 EGFR 突变、结直肠癌 KRAS / NRAS / BRAF
FISH(荧光原位杂交)某个基因是否扩增或断裂重排HER2 扩增、ALK / ROS1 重排、淋巴瘤 MYC 重排
NGS(二代测序)一次检测多个基因的突变、融合、扩增等肺癌多基因检测、TMB、罕见融合
MSI 检测错配修复功能是否缺陷结直肠癌、子宫内膜癌等,与免疫治疗有关
甲基化检测特定基因启动子是否甲基化胶质母细胞瘤 MGMT,与替莫唑胺疗效相关

方法之间没有绝对的优劣:需要检测的基因很少、希望尽快出结果时,PCR 或 FISH 可能更合适;需要同时排查多个基因,或组织有限、不宜逐个检测时,NGS 通常更节省组织。

免疫组化检测的是蛋白,属于病理染色,但常与分子检测配合使用,例如 MMR 蛋白免疫组化与 MSI 检测都可以评估错配修复状态。

什么情况下医生可能建议分子检测

医生可能建议检测
晚期非小细胞肺癌,尤其是腺癌
晚期结直肠癌、胃癌、胆道肿瘤、乳腺癌、卵巢癌等
需要评估是否适合免疫治疗,如 MSI 状态
脑胶质瘤、淋巴瘤、肉瘤等需要分子分型
靶向治疗后出现耐药,需要寻找原因
原发不明或罕见肿瘤,常规治疗选择有限
意义可能有限
早期肿瘤且检测结果不会改变当前治疗
身体状况不允许接受任何后续治疗
组织质量很差,结果可能不可靠
未经医生评估、盲目追求检测更多基因
癌种常见检测内容
非小细胞肺癌EGFR、ALK、ROS1、KRAS、BRAF、MET、RET、HER2、NTRK 等
结直肠癌KRAS / NRAS、BRAF、MSI 或 MMR、HER2
乳腺癌晚期时可能检测 PIK3CA、ESR1、BRCA1/2 等
卵巢癌BRCA1/2、同源重组修复缺陷(HRD)
脑胶质瘤IDH、1p/19q 共缺失、MGMT 甲基化等

具体检测项目会随指南和可用药物更新而变化,以主治医生建议为准。

需要什么样本:组织还是血液

肿瘤组织通常是首选样本,一般使用活检或手术后的蜡块或白片。检测要求组织中有足够比例的肿瘤细胞,病理医生会先评估并圈出肿瘤区域。穿刺组织过少、坏死过多,或骨组织经强酸脱钙,都可能导致检测失败。

当组织难以获取或不足时,可以抽血检测血液中的循环肿瘤 DNA(ctDNA),即液体活检。血液检测创伤小,但如果肿瘤释放到血中的 DNA 较少,可能出现假阴性,因此血液检测阴性时,医生常会建议在条件允许时补做组织检测。

组织样本:蜡块、白片,部分情况可用细胞蜡块或胸腹水标本
血液样本:专用采血管抽取外周血,需按要求尽快送检
对照样本:部分 NGS 检测会同时抽血,用于区分肿瘤变异与胚系变异

检测流程与多久出结果

1
医生确定检测问题

根据癌种、分期、既往治疗和已有结果,决定检测哪些基因、用哪种方法。

2
病理评估样本

病理医生确认组织中肿瘤细胞含量是否足够,选出合适的蜡块或切片。

3
提取核酸与检测

从样本中提取 DNA 或 RNA,按所选方法完成检测;NGS 还需要测序和数据分析。

4
结果分析与解读

分子病理医生或实验室专业人员按证据等级判断变异的意义,写出报告。

5
与医生讨论报告

临床医生结合病情判断结果对治疗的意义,必要时在多学科会诊中讨论。

多久出结果

单基因的 PCR 或 FISH 检测通常较快;多基因 NGS 检测流程更长,一般需要更多工作日。样本需要转送、质控不合格需要补样或重新检测时,时间还会延长。病情急需治疗时,医生可能先选择较快的检测方法。

如何理解分子检测报告

多基因检测报告常参考 AMP/ASCO/CAP 等标准,把体细胞变异按临床意义分为四级。不同机构的写法略有不同,常见思路如下:

常见分级含义
一级:有明确临床意义本癌种有获批药物或指南推荐的治疗与之对应
二级:有潜在临床意义其他癌种有获批药物,或有临床试验、早期研究证据
三级:意义未明变异(VUS)目前证据不足以判断是否与肿瘤有关,一般不据此用药
四级:良性或可能良性通常不影响治疗
报告可以说明
是否存在有对应药物的基因变异
MSI、TMB 等与免疫治疗相关的指标
部分肿瘤的分子分型
是否提示可能存在胚系变异、需进一步确认
报告不能说明
检测到可用药变异不代表药物一定有效
未检测到变异不代表肿瘤一定没有该变化
意义未明变异的临床意义
具体选择哪种治疗,这需要医生综合判断

报告中还可能出现变异丰度(VAF)等数值,其意义与肿瘤细胞含量有关,应由医生结合病情解读。

与胚系基因检测、免疫组化的区别

肿瘤分子检测胚系基因检测
检测对象肿瘤组织或血液中的肿瘤 DNA血液或唾液中的正常细胞 DNA
回答的问题肿瘤有哪些变化、可能适合哪些药物是否携带遗传性致病变异
对家人的意义一般不直接涉及可能提示家人需要评估或筛查
常见例子EGFR 突变、ALK 融合、MSIBRCA1/2、林奇综合征相关基因

部分肿瘤检测结果会提示可能存在胚系变异,例如肿瘤中发现 BRCA1/2 变异,这时医生可能建议进一步做胚系基因检测并接受遗传咨询。免疫组化则检测组织中的蛋白表达,与分子检测互为补充,不能完全替代。

是否需要重新取样

以下情况下,医生可能建议重新活检或补充血液检测:

原有组织不足或质量不合格,检测失败
靶向治疗后病情进展,需要了解耐药原因
原检测范围有限,未覆盖目前指南推荐的基因
旧样本距今较久,病情已明显变化

重新活检有一定风险。组织难以获取时,血液检测可以作为补充,但不能完全替代组织检测。

在中国进行分子检测与寄送资料

中国大型肿瘤中心普遍开展 PCR、FISH、NGS 等分子检测,部分医院与第三方检测机构合作。不同检测的范围、方法和收费差异较大,是否需要重新检测、检测哪些基因,以医院评估为准。部分用于指导用药的检测试剂已获国家药品监督管理局批准,开展基因扩增类检测的临床实验室也需通过相应的技术审核,可向医院了解所用方法。

中国对人类遗传资源(包括含有人体基因信息的样本和数据)的采集、保存、出境及用于科研等有专门的管理规定,在中国采集的样本或检测数据如需带出境或用于研究,可能受到限制。如计划把在中国检测后剩余的样本或数据带回原居地,宜事先向医院确认。

已有报告提供已做过的分子检测报告,避免不必要的重复检测
样本原病理报告,以及按要求准备的蜡块或白片
出结果单基因检测较快,多基因检测需要更长时间
跨境寄送生物样本出入境与快递要求因地区而异,寄送前需确认
不确定需要做哪种分子检测?

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常见问题

不一定。检测范围应根据癌种和临床问题选择。检测更多基因可能发现更多变异,但也会带来更多意义未明的结果,费用和时间也可能增加。
要看之前检测的时间、范围和病情变化。如果原检测未覆盖目前推荐的基因,或治疗后出现进展,医生可能建议补充检测。
组织检测通常是首选。血液检测创伤小,适合组织不足或需要动态观察时,但阴性结果不能完全排除变异,必要时仍需组织检测。
意义未明变异是指目前证据不足以判断其意义,一般不作为用药依据,也不代表病情更严重。随着研究积累,部分变异的分级将来可能更新。
肿瘤分子检测主要看肿瘤本身的变化,不能直接判断遗传风险。如果结果提示可能有胚系变异,医生会建议做胚系基因检测和遗传咨询。

参考文献

  1. National Comprehensive Cancer Network (NCCN). NCCN Clinical Practice Guidelines in Oncology.
  2. Association for Molecular Pathology (AMP) / ASCO / CAP. Standards and guidelines for the interpretation and reporting of sequence variants in cancer.
  3. 中国临床肿瘤学会(CSCO)诊疗指南.
  4. 中国抗癌协会、中华医学会病理学分会等. 肿瘤分子病理检测相关专家共识.
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